怪事件の謎に巴里華撃団・花組が迫る！ 平和がもどってきた巴里の街、そこで華やかなレビューを繰り広げる花組のメンバーたち。 そこに突如として降りかかる謎の行方不明事件。 エリカ、コクリコ、グリシーヌ、ロベリア、花火といった巴里花組の面々は、それぞれ踊り子の足取りを追おうとする。 そこへ登場するのが 「紅蜥蜴」 に登場した名探偵のモデルとなった青年・明智小次郎。 彼は、妹のミキがシャノワールに踊り子として在籍している繋がりから、巴里へと赴く。 そして、プレイヤーは小次郎（ミキ）となって、事件の中核へと迫っていく。 果たして、プレイヤーは巴里の危機を救えるのか？