「ふしぎに海のナディア」はガイナックスが制作し1990年にNHKで放送され、大変な人気を集めたアニメ作品です。プレイヤーは主人公ジャンとなり、ナディアとブルーウォーターを巡る冒険を繰り広げていきます。ゲームは、会話を中心とした「アドベンチャーシーン」と、潜水艦戦を表現した「シミュレーション」の2つのゲームシーンを行き来し、TVアニメを元に全10章に再校正したストーリーを進行させていきます。更にTVアニメには登場しなかった、ゲームオリジナルの新キャラクター2人を追加して、TVアニメーション版のストーリーを元にオリジナル要素と独自解釈を加えた内容になっています。