アメリカの秘密部隊"サードエシュロン"の一員、サム・フィッシャーは、一連のテロ活動とゲリラ組織が根絶されるまで、インドネシアおよび別の地域でアメリカ軍を守り、支援するという任務に就くことになった…。目的を達成するためには手段を選ばない彼らは、世界を天然痘の恐怖へ陥れようと企む。刻々と迫る恐怖と陰謀の影から世界を救うのだ。