あのスーパーパズルボブルとスーパーパズルボブル２が１つになってパワーアップして帰ってきた！自分だけのパズルボブルを作れる「エディットモード」がより一層豊かなバリエーションになったぞ。スーパーパズルボブル２では全てのキャラクターにそれぞれのお話が用意されているぞ。各ステージ間にはキャラクターたちのイベントシーンが挿入されてお話を盛り上げてくれるのだ。