娘を連れて休暇先に出かけた主人公ハリー。事故で崖下に転落し目覚めたとき、車内に娘の姿はなかった・・・。目の前には深い霧に包まれ、不気味に静まり返った町がある。ハリーは娘を捜しに霧と闇に閉ざされた町「サイレントヒル」へと足を踏み入れてゆくが、そこには見たことも無いモンスターたちが徘徊していた。